鸡蛋受微生物侵染而发生腐败，也很容易辨别。除个别人有吃臭鸡蛋的嗜好外，绝大多数人不会因鸡蛋腐败变质而受到健康伤害。即使鲜蛋被沙门氏菌侵染(发生率很低)，对中国人的健康威胁也很小。因为中国人没有生食鸡蛋的习惯，煎炒蒸煮都可以灭杀这类致病菌。 

鸡蛋中也可能含有在母鸡饲养过程中人为引入的有害成分。但是，这些有害成分首先要经过母鸡的消化系统，被分解、排泄之后，能残留而进入鸡蛋中的有害风险被大大降低。例如，以前曾被广泛报道的苏丹红，鸭蛋中的残留量比鸭体内(脂肪中)少很多。一旦摄入过多的有害成分，母鸡也会闹病、罢工而减少产蛋，所以饲养户也会对鸡饲料严格把关。虽然造假的鸡蛋也曾被发现过，但极其罕见、并且很容易被识别。鸡蛋也可能含有微量的激素类成分(曾有人广而告知)，但禽类的激素不同于哺乳动物，还没有科学依据证明禽类的激素对人有何影响。当然还会有很多可能在母鸡饲养过程中引入的危害风险，但鸡蛋所含有的这类危害因素鸡不会高于鸡肉、也不会高于其它动物食品。 

对于胆固醇，很多人缺乏正确认识。胆固醇也是人体必需的一种成分，在人体内既能被分解、也能被合成。虽然国外有些研究宣称过，平均每天食用超过N个鸡蛋，患XX病的风险会增高。但姜微波对这些研究的原始报道核实后认为，这些研究并没有考虑被调查者除了直接食用鸡蛋，还大量食用富含蛋黄的食品如蛋糕、冰激凌等方面的因素。动物脂肪摄入过多，才是某些人体内胆固醇含量过高的根本原因。适量食用鸡蛋，完全不必担心胆固醇的危害问题。